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首個亞洲家豬“超清”基因組圖譜發布

更新時間:2019-10-15    點擊次數:367次    文章來源:河南科技報

近日,我國發布首個亞洲家豬“超清”基因組圖譜,這不僅填補了亞洲家豬缺少高質量參考基因組的空白,更為基因組組裝提供了新的方向。該項成果由中國農業科學院深圳農業基因組研究所(以下簡稱“基因組所”)豬基因組設計育種創新團隊主導完成。
項目負責人、基因組所研究員唐中林說,利用多項測序技術和組裝算法,他們首次獲得了染色體級別、完整的兩套基因組序列。這標志著來自親本的等位基因可以完整區分,為研究等位基因的功能互作提供了寶貴的數據和技術基礎,具有重要的理論和應用價值。
“包括人在內的很多物種,都是二倍體。也就是說,每一個二倍體個體中都有兩套不同親本來源的單倍體序列。我們組裝得到的豬基因組,除了有很高的連續性外,更是成功地獲得了兩套染色體級別的基因組序列,這在基因組組裝研究領域尚屬首次?!碧浦辛终f,“這意味著我們可以同時研究同源染色體的變異,以及來自不同親本的等位基因功能。這是基因組學領域科學家們夢寐以求的,今天我們向前邁了一大步?!?/span>
據介紹,東西方豬種擁有各自獨立的馴化起源,分屬兩個不同的進化分支,且具有明顯的形態和遺傳學差異。然而,目前豬基因組學研究采用的是西方豬種杜洛克(Duroc)的基因組序列,這在一定程度上限制了對亞洲家豬的基因組學研究。
唐中林介紹,我國是世界上最大的生豬養殖和豬肉消費國,擁有全球1/3的豬品種。這些資源是深入挖掘地方豬肉質和抗病力等重要性狀優質基因的遺傳寶庫。然而,隨著西方商業豬種的普及,本地豬種受到了非常大的沖擊,對地方豬種質資源的保護刻不容緩,尤其在面對非洲豬瘟挑戰的今天。因此,該基因組圖譜的發布具有重要的戰略意義。
(李 晨)